《瘟疫论》为明代医家吴有性撰著，是我国第一部温病学专著。书成于明崇祯壬午年（1642）。全书分上、下两卷。上卷50篇，论述原病、瘟疫初起、传变不常、发斑等；下卷37篇，述及杂气、蛔厥等病症。作者汇萃前人对疫病的论述，结合自己毕生治疗瘟疫病心得和经验，系统地论述了瘟疫的病因、发病条件、传染方式、病变特点以及临床表现、诊断方法、治法方药等。书中首创瘟疫病因学说，揭示出“邪从口鼻而入”的侵袭途径，明晰瘟疫与伤寒之区别，总结创新出瘟疫病的治疗原则和方法，对后世温病学的发展产生了巨大影响。本书立论明确，观点鲜明，切合临床实际，是学习和研究中医外感热病学重要的参考著作。